原因有两种。一是乳糖不耐受，一是牛奶过敏。
乳糖酶缺乏可分为两大类：先天性和后天性。
先天性乳糖酶缺乏，是一种遗传缺陷，宝宝出生时体内即无乳糖酶。由于母乳、牛奶等都含有乳糖，故患儿吃不了母乳，也喝不了牛奶。不过，这个概率很小。这种类型的患儿可以米汤类食物代替，或喝无乳糖或含乳糖低的配方奶粉。
后天性乳糖酶缺乏，多数是由于长期没有喝牛奶，机体合成乳糖酶的功能退化，或是疾病等原因，导致乳糖酶分泌不足或缺乏。绝大多数乳糖不耐受者均属此类。此时，患儿可喝无乳糖或含乳糖低的配方奶粉，也可尝试喝酸奶。
此外还可试着少量多次，渐渐适应。具体方法是：每天喝牛奶5一10毫升，一个星期后再逐渐增加饮用量。这样不仅可以减轻或避免乳糖不耐受，而且可刺激和提高小肠黏膜合成乳糖酶的能力，逐渐消除乳糖不耐受症。
牛奶过敏表现为孩子喝了几次牛奶后，出现呕吐、腹痛、腹泻，大便稀，有时还带血，往往同时还出现湿疹、荨麻疹、哮喘。这是由于孩子肠道的通透性高，牛奶中的蛋白质透过肠黏膜上皮，使黏膜下的免疫细胞发生过敏，再次喝牛奶时，致敏的细胞就会发生过敏反应的缘故。
针对牛奶过敏有两种解决办法：
①改吃其他的代乳品，如羊奶、豆奶、营养米粉等。
②试用脱敏疗法。牛奶先烧开煮透，使其中的蛋白质充分变性，最初每天只喝10毫升，如无不良反应。连喝三天后增加到每天15毫升;如果仍无不良反应，再喝三天后增加到20毫升。奶量不断增加，间隔时间也可逐步缩短。如果症状不再出现，说明脱敏有效，以后便可过渡到正常喂养;如果症状仍然出现，而且越来越重，则不要再勉强进行。
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